Parte benissimo dalla Pole Toprak Razgatlioglu, che però a metà del primo giro viene passato da Jonathan Rea che prova sin da subito a dettare il ritmo. A 17 giri dal termine cade Axel Bassani, probabilmente per una perdita di aderenza alla curva 10, mentre Resta al comando Jonathan Rea, seguito da Razgatlioglu e Bautista, ma nella seconda metà di gara il pilota turco della Yamaha sferra l'attacco a Rea e si porta al comando.
A contendersi il gradino più alto del podio c'è anche Alvaro Bautista, in terza posizione, che al termine del 12esimo giro sfrutta il motore Ducati e si porta alle spalle di Razgatlioglu. Ancora un paio di giri e Bautista prende il comando della gara e inizia ad allungare di qualche decimo, ma Toprak non si da per vinto e cerca di guadagnare decimi preziosi per poter attaccare lo spagnolo. Cade Lecuona alla curva 14, perde l'anteriore e scivola nella ghiaia, ma grazie all'intervento tempestivo dei marshall riesce a rientrare in pista.
Molla il colpo Jonathan Rea, in terza posizione, mentre Toprak Razgatlioglu sorpassa Bautista, il quale però in rettilineo si riporta davanti. Si conclude così l'ultima gara del weekend Portoghese, con la vittoria in Gara 2 di Alvaro Bautista seguito da Toprak Razgatlioglu e Jonathan Rea.
Nelle pagine successive trovate i risultati delle tre gare e la classifica campionato. L'appuntamento è per il weekend del 21-23 ottobre, dove si correrà fra i cordoli del circuito San Juan Villicum, in terra Argentina.